“9·11”以后，经历了与恐怖分子战争的各发达国家，选择牺牲个人自由空间而建立起严格的管理体制，以此与恐怖袭击对抗，恐怖活动被扫荡一空。另一方面，欠发达国家发生内战和大规模屠杀的数量急剧增强，世界渐渐被一分而二。克拉维斯大尉率领的军事情报特殊搜索群i分队是唯一负责暗杀的特种部队。为了维系战斗时的心理状态，他们接受了“感情适应调整”、“痛感屏蔽”等医疗措施，更可以在瞬间读懂暗杀对象的心理活动并做出应对。作为精锐部队，他和部下从事暗杀在世界各地引起纷争的祸首的任务。这时，有一个叫约翰·保罗的人出现在暗杀名单中。这个神秘的语言学者造访过的国家必然出现将陷入混乱的兆头，半年内一定会发生内战和虐杀。而约翰行踪不定，看起像是在世界各地传播虐杀的种子。克拉维斯等人开始在人们最后看到约翰的布拉格展开调查，试图从与约翰接触过的其前学生露西娅身上打开突破口。克拉维斯向露西娅询问关于约翰的情况时，被她的魅力深深吸引。而在与约翰正面对峙的瞬间，克拉维斯了解了有关“引发屠杀的器官”的真相。
